İçeriğe geç
akaturk Akademik ölçüm
Giriş yap Kayıt ol

Akademisyen

EZGİ KARACA EREK

DOKTOR ÖĞRETİM ÜYESİ (Unvan:Doçent)

DOKUZ EYLÜL ÜNİVERSİTESİ İZMİR ULUSLARARASI BİYOTIP VE GENOM ENSTİTÜSÜ BİYOTIP VE SAĞLIK TEKNOLOJİLERİ ANABİLİM DALI

Araştırma konuları OpenAlex
  1. Ana Dal Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı
  2. Yan Dal Moleküler Biyoloji ve Genetik
Anahtar kelimeler YÖKSİS
Akademik özet YÖKSİS ve OpenAlex ayrı sayılır.
Makale 50
YÖKSİS50 OpenAlex0
Proje 1
Kitap 5
Bildiri 1

Atıf etkisi

OpenAlex YÖKSİS makalelerinden OpenAlex’te eşleşen: 49
h-indeks 23 Türkiye yüzdelik dilimi: 98 Üniversitesinde h-indekse göre 42. / 2.134
i10-indeks
34
Toplam atıf
5.219
Türkiye’de üst %0,3
Makale başına
106,5
FWCI
4,74
1,00 = dünya ortalaması
Dünyada üst %1
3
Dünyada üst %10
21

En çok atıf alan makaleleri

  1. The HADDOCK2.2 Web Server: User-Friendly Integrative Modeling of Biomolecular Complexes 2016 dünyada üst %1 3.022 atıf
  2. The HADDOCK2.4 web server for integrative modeling of biomolecular complexes 2024 dünyada üst %1 617 atıf
  3. Prediction of homoprotein and heteroprotein complexes by protein docking and template‐based modeling: A CASP‐CAPRI experiment 2016 dünyada üst %1 169 atıf

h-indeks ve atıflar, bu akademisyenin YÖKSİS makalelerinden OpenAlex’te eşleşenlerin atıf sayılarından hesaplanır (Google Scholar, WoS veya Scopus değildir). Eşleşmeyen makalelerin atıfı dahil değildir.

Alan sıralaması

YÖKSİS ?

İşbirliği ağı

YÖKSİS eser kayıtlarındaki yazar listelerinden. Aynı eserin mükerrer kayıtları bir kez sayılır; kurumlar ortak yazarların YÖKSİS’teki güncel kurumudur.

Ortak yazar
292
akaturk profili olan
35
Ulusal kurum
14
Ortak yazarlı eser
%98

Ortak çalıştığı akademisyenler 35

  1. AYŞE ELİF ERSON BENSAN Profesör · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 3
  2. AYŞE SEMRA HIZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 3
  3. GÖKHAN KARAKÜLAH Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 3
  4. TÜRKAN HALİLOĞLU Profesör · Boğaziçi Üniversitesi 3
  5. MUHAMMED KASIM DİRİL Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 2
  6. SERDAR DURDAĞI Profesör · Bahçeşehir Üniversitesi 2
  7. ULUÇ YİŞ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 2
  8. İBRAHİM ÖZGÜL Araştırma Görevlisi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 2
  9. AHMET KATI Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1
  10. AHMET SÜREYYA RİFAİOĞLU Doktor Öğretim Üyesi · Hacettepe Üniversitesi 1
Tümünü göster (35)
  1. ARİF MERMER Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1
  2. ATHANASIA PAVLOPOULOU Doktor Öğretim Üyesi · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
  3. BERNA DOĞAN Doktor Öğretim Üyesi · İstanbul Teknik Üniversitesi 1
  4. BURAK VELİ KABASAKAL Doktor Öğretim Üyesi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 1
  5. BURCU KAPLAN TÜRKÖZ Doçent · Ege Üniversitesi 1
  6. BİLGE ÖZGÖR Doçent · İnönü Üniversitesi 1
  7. ENES SEYFULLAH KOTİL Doktor Öğretim Üyesi · Boğaziçi Üniversitesi 1
  8. ERHAN BAYRAM Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 1
  9. GAMZE YEŞİLAY Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1
  10. GİZEM DİNLER DOĞANAY Profesör · İstanbul Teknik Üniversitesi 1
  11. HALİLİBRAHİM ÇİFTÇİ Profesör · Burdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi 1
  12. HASAN DEMİRCİ Doçent · Koç Üniversitesi 1
  13. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN Profesör · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1
  14. HÜSEYİN TUNÇ Doktor Öğretim Üyesi · Bahçeşehir Üniversitesi 1
  15. MEHMET ÖZTÜRK Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 1
  16. MURAT SARI Profesör · İstanbul Teknik Üniversitesi 1
  17. SERAP ERKEK ÖZHAN Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
  18. SEVDE ALTUNTAŞ Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1
  19. SEYİT KALE Doktor Öğretim Üyesi · İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1
  20. SULTAN CİNGÖZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
  21. TÜLAY ÖNCÜ ÖNER Doktor Öğretim Üyesi · Manisa Celâl Bayar Üniversitesi 1
  22. YAVUZ OKTAY Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
  23. ŞABAN TEKİN Profesör · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1
  24. ŞERİF ŞENTÜRK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
  25. ŞERİFE ESRA ERDAL BAĞRIYANIK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1

Ulusal işbirliği 14 kurum

Kurum içi8 ortak eser · Dokuz Eylül Üniversitesi

  1. Boğaziçi Üniversitesi 4 eser · 2 akademisyen
  2. Orta Doğu Teknik Üniversitesi 4 eser · 3 akademisyen
  3. Bahçeşehir Üniversitesi 2 eser · 2 akademisyen
  4. İstanbul Teknik Üniversitesi 2 eser · 3 akademisyen
  5. İzmir Tınaztepe Üniversitesi 2 eser · 2 akademisyen
  6. Burdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  7. Ege Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  8. Hacettepe Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  9. Koç Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  10. Manisa Celâl Bayar Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
Tümünü göster (14)
  1. Sağlık Bilimleri Üniversitesi 1 eser · 5 akademisyen
  2. İnönü Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  3. İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
  4. İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1 eser · 1 akademisyen

Diğer ortak yazarlar (yabancı yazarlar dahil) 257

Alexandre MJJ Bonvin 15Panagiotis Kastritis 9Adrien S Melquiond 8Joao PGLM Rodrigues 8Burcu Özden 6Büşra Savaş 6Marc van Dijk 5Christophe Schmitz 4Mehmet Ergüven 4Mikaël Trellet 4Sjoerd de Vries 4TÜLAY KARAKULAK 4Zundert Gydo van 4İREM YILMAZBİLEK 4Andriy Kryshtafovych 3Didem Naz Dioken 3Mehdi Koşaca 3Melda Tozluoğlu 3Ruth Nussinov 3Aleksandra Bebel 2Andrea Graziadei 2Annalisa Bordogna 2Atakan Özsan 2Ayşe Berçin Barlas 2Ayşe Berçin Barlas Yılmaz 2Brian Jiménez-García 2Eda Şamiloğlu 2Orsolya Barabas 2SEVAL KILIÇ 2TOLGA CAN 2AHMET YARAMIŞAYÇA ÇIRÇIRAbdullah KEPCEOĞLUAdriana ContrerasAdrien S. J. MelquiondAhmet BursalıAileen PetersAlaleh SHAFIEIAlbert SolernouAlexandros G. Georgakilas

Tümünü göster (257)

Aleyna ErayAli HamicheAlirıza ArıbaşAlma BalestrazziAmande PaulsAna TöpfAndrea RentmeisterAndreas RoosAnna L DuncanAnna Rubio-CosialsAnna VangoneAnnageldi AshyralyyevAnnalisa PastoreAnne KoyAnnette HornAybike ErdoğanAyşegül PAZARÇEVİRENAyşenur YILMAZBanushree KumarBarış ÇAKILKAYABaşak CANBAYBengisu AŞCIBilge TOSUNBirgit AssmannBradley P. CoeBrian G. PierceBurcu EkinciBüsra Nur Darendeli KirazCahine KULAKMANCan YükrükCarlo PetosaCarlos Rojas-CordovaChantal PrevostChaok SeokCharlotte W. van NoortChiara PallaraChristian EggelingChristian MT SpahnColin KleanthousCunlian CengDaniel G. MacArthurDaniel J. RigdenDaniel-Cosmin MarcuDaron M. StandleyDavid SchwefelDavid W. RitchieDeborah A. NickersonDenisa HathaziDeniz KaragözoğluDhanya CheerambathurDima KozakovDimitar AngelovECE SÖNMEZLER ADALIERDİNÇ SEZGİNESRA ÇİÇEKEbru DestanEfrat FarkashEiji KanamoriEike C SchulzElanur AlmericElmasnur YilmazEnver Kamil AkcanEsra AyanEsra KARTALEvan E. EichlerFabian SchildhauerFatma Betül ErtemFrancis J O’ReillyGaetano T. MontelioneGeorgy DerevyankoGeorgy SmyshlyaevGilbert WunderlichGiuseppe NicastroGizem TuranGÖZDE KÖKSAL BIÇAKCIGÜNEY BADEMCİGözde KARAKADIOĞLUGülden Özden YılmazGünce GÖÇGünseli YILDIRIMHahnbeom ParkHaim J. WolfsonHanns LochmullerHaruki NakamuraHasup LeeHazal AytenHelge EwersHenry L. PaulsonHiroshi TATEISHIHolger ThieleHormos Salimi DafsariHowook HwangHuan-Xiang ZhouHülya-Sevcan DaimagülerIain H. MoalIdit BuchIlya A. VakserImtiaz N. LoneIpek KalafatcilarIrem Cemile ErogluIsabelle VernosJ Austin JOHNSONJan BednarJanine AltmüllerJeffrey J. GrayJianqing XuJohn MoultJohn WietingJorge Roel-TourisJoy SarmientoJoão P RodriguesJuan Fernández-RecioJulie C. MitchellJunsu KoJuri RappsilberJustyna A. WojdylaJörg J. SchaarschmidtKardelen ŞABANOĞLUKarl Emanuel BuschKarl KieningKate JeffreyKengo KinoshitaKerstin BeckerKita SchmidtKoen M VisscherKrishna Praneeth KilambiKristoffer ForslundLaura Pérez-CanoLensink Marc FLi C XuwLotte LambertsenMESUT MUYANMUSTAFA CENGİZ YAKICIERMUSTAFA TEKİNALP GELENMahmut AslanManja KlossMarchel StuiverMarco GiuliniMark S. P. SansomMartin ZachariasMasami OTSUKAMatsuyuki ShirotaMatthieu ChaventMehdi NellenMehmet GülMehmet ÇALISEKİMelis OktayoğluMerve YILMAZMikako FUJITAMira Schulze-RhonhofMiriam EisensteinMuratcan MenteşMustafa ÇicelNazlı Eylül ARSLANNazmiye ArslanNecati AtalayNilüfer BALDIRNora SzaboNurettin TOKAYOzgun OzalpPanagiotis I. KoukosPaul A. BatesPeer BorkPelin TokerPeter NürnbergPetra SJ RylPetras J. KundrotasPravin MuthuRamachandran BoopathiRita HorvathRodrigo V. HonoratoRosanne SpruteSERDAL GÜNGÖRSanbo QinSandor VajdaSapthaswaran VeerapathiranSebahattin CirakSergei GrudininSergi BeltranSerra TAVLISeyide Seda PAYDOSShahram MesdaghiShen-You HuangShoshana J. WodakSiddarth NarasimhanSimon M LauerSokol TodiSolène GrosdidierSophie Sacquin-MoraStefan DimitrovSteven LaurieSunitha BalarajuSwantje LenzTeresa CarlomagnoThom VrevenThorsten WohlandUniversity of Washington Center for Mendelian GenomicsUtku Cem YılmazVasileios R OuzounidisVictor ReysW Marshall StarkXiaoqin ZouYang ShenYağmur AzbazdarYoichi MurakamiYuko TsuchiyaZEYNEP KÜRKÇÜOĞLU SONERZeliş NERGİZZeynep Sena ÇİNALZhiping WengZuzana JandováÁlvaro Aranguren-IbáñezÇAĞLA ECE OLGUNÇİĞDEM ERESEN YAZICIOĞLUÖmür GÜVENİlkin YAPICIŞevki Onur Henden

akaturk profili olmayan yazarlar (yabancı araştırmacılar, emekli/ayrılmış akademisyenler, öğrenciler, klinisyenler) isim yazımına göre birleştirilir; “Güllüce M.” gibi kısaltmalar tek bir tam adla eşleşiyorsa o kişiye eklenir.

Dizin çeyrekleri

?
Scopus (SJR) 47
  • Q1 39 %83,0
  • Q2 8 %17,0
  • Q3 0 %0,0
  • Q4 0 %0,0
WoS (JCR) 48
  • Q1 22 %45,8
  • Q2 20 %41,7
  • Q3 5 %10,4
  • Q4 1 %2,1
TR Index 4 makale
OpenAlex atıf yüzdelik
Üst %13
Üst %1021
Ort. · n 49 %77,7
Diğer sayımlar

Scopus (SJR)

  • YÖKSİS satırı 47

WoS (JCR)

  • YÖKSİS satırı 48

Makaleler

YÖKSİS ve OpenAlex kaynak ayrımıyla makaleler; quartile ve TR Index ile daraltabilirsiniz.

50makale

Yayını olan dergiler

34 dergi

Daralt

Scopus (SJR)
Q139 Q28 Q30 Q40
WoS (JCR)
Q122 Q220 Q35 Q41
TR Index
4makale

Makale listesi

  1. 2025 Towards a Greener AlphaFold2 Protocol for Antibody–Antigen Modeling: Insights From CAPRI Round 55 Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics DOI 10.1002/prot.26820 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 90.1%
  2. 2025 So close yet so far apart: distinct flanking sequence recognition by DNMT3A and DNMT3B Communications Biology DOI 10.1038/s42003-025-08606-7 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 55.5%
  3. 2025 An NADH-controlled gatekeeper of ATP synthase Molecular Cell DOI 10.1016/j.molcel.2025.06.007 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex üst %10 OpenAlex 91.9%
  4. 2025 E2-regulated transcriptome complexity revealed by long-read direct RNA sequencing: from isoform discovery to truncated proteins RNA Biology DOI 10.1080/15476286.2025.2563860 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 74.9%
  5. 2024 Dynamic proximity interaction profiling suggests that YPEL2 is involved in cellular stress surveillance Protein Science DOI 10.1002/pro.4859 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 74.0%
  6. 2024 The HADDOCK2.4 web server for integrative modeling of biomolecular complexes Nature Protocols DOI 10.1038/s41596-024-01011-0 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex üst %1 OpenAlex 100.0%
  7. 2023 Prediction of HIV-1 protease resistance using genotypic, phenotypic, and molecular information with artificial neural networks PeerJ DOI 10.7717/peerj.14987 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 84.2%
  8. 2023 The impact of AI‐based modeling on the accuracy of protein assembly prediction: Insights from CASP15 Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics DOI 10.1002/prot.26598 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 96.1%
  9. 2023 Breaking the conformational ensemble barrier: Ensemble structure modeling challenges in CASP15 Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics DOI 10.1002/prot.26584 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 93.9%
  10. 2023 Cryogenic X-ray crystallographic studies of biomacromolecules at Turkish Light Source "Turkish DeLight" Turkish Journal of Biology DOI 10.55730/1300-0152.2637 YÖKSİS TR Index SJR Q2 JCR Q3
  11. 2023 PROT-ON: A structure-based detection of designer PROTein interface MutatiONs FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES DOI 10.3389/fmolb.2023.1063971 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 47.4%
  12. 2023 An alternatively spliced PD-L1 isoform PD-L1∆3, and PD-L2 expression in breast cancers: implications for eligibility scoring and immunotherapy response Cancer Immunology, Immunotherapy DOI 10.1007/s00262-023-03543-y YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 86.0%
  13. 2023 Benchmarking the accuracy of structure‐based binding affinity predictors on Spike–ACE2 deep mutational interaction set Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics DOI 10.1002/prot.26645 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 58.6%
  14. 2023 Differential Occupancy and Regulatory Interactions of KDM6A in Bladder Cell Lines Cells DOI 10.3390/cells12060836 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 51.9%
  15. 2023 Molecular Mechanism of Nucleosome Recognition by the Pioneer Transcription Factor Sox JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING DOI 10.1021/acs.jcim.2c01520 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 73.0%
  16. 2022 Novel biallelic variants affecting the OTU domain of the gene OTUD6B associate with severe intellectual disability syndrome and molecular dynamics simulations European Journal of Medical Genetics DOI 10.1016/j.ejmg.2022.104497 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q4 OpenAlex 64.9%
  17. 2022 Enzymatic Generation of Double‐Modified AdoMet Analogues and Their Application in Cascade Reactions with Different Methyltransferases ChemBioChem DOI 10.1002/cbic.202200511 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q3 OpenAlex 74.1%
  18. 2022 VARS1 Mutations Associated with Neurodevelopmental Disorder Are Located on A Short Amino Acid Stretch of The Anticodon-Binding Domain Turkish Journal of Biology DOI 10.55730/1300-0152.2631 YÖKSİS TR Index SJR Q2 JCR Q3 OpenAlex 54.7%
  19. 2022 Modeling the Dynamics of Protein–Protein Interfaces, How and Why? Molecules DOI 10.3390/molecules27061841 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 77.8%
  20. 2022 Genetic complementation screening and molecular docking give new insight on phosphorylation-dependent Mastl kinase activation Journal of Biomolecular Structure and Dynamics DOI 10.1080/07391102.2022.2131627 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q1 OpenAlex 53.6%

← Akademisyenlere dön