Akademisyen
EZGİ KARACA EREK
Doçent
Dokuz Eylül Üniversitesi İzmir Uluslararası Biyotıp Ve Genom Enstitüsü Biyotıp Ve Sağlık Teknolojileri Anabilim Dalı
- Protein Structure and Dynamics18
- RNA and protein synthesis mechanisms13
- Enzyme Structure and Function10
- RNA modifications and cancer7
- Ubiquitin and proteasome pathways6
- Computational Drug Discovery Methods5
- RNA Research and Splicing4
- Bioinformatics and Genomic Networks4
- Genetics and Neurodevelopmental Disorders4
- Microtubule and mitosis dynamics3
- Epigenetics and DNA Methylation3
- Genomics and Chromatin Dynamics3
- Ana Dal Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı
- Yan Dal Moleküler Biyoloji ve Genetik
Atıf etkisi
OpenAlex’te eşleşen makalelerin atıf sayıları, Crossref’ten atıf yapan yayınlar ve Stanford/Elsevier listesi. Kaynaklar ayrı gösterilir, hiçbir zaman toplanmaz.
- i10-indeks
- 37
- Toplam atıf
- 5.277 Türkiye’de üst %0,4
- Makale başına
- 101,5
- FWCI
- 4,55 1,00 = dünya ortalaması
- Dünyada üst %1
- 3
- Dünyada üst %10
- 21
En çok atıf alan makaleleri
Nasıl hesaplanır?
h-indeks ve atıflar, bu akademisyenin YÖKSİS makalelerinden OpenAlex’te eşleşenlerin atıf sayılarından hesaplanır (Google Scholar, WoS veya Scopus değildir). Eşleşmeyen makalelerin atıfı dahil değildir. Ortak yazarların YÖKSİS kayıtlarında bu akademisyenin YÖK kimliğiyle etiketlenen 3 makale (58 atıf) yalnızca atıf, h-indeks ve i10 hesabına katılır; makale sayıları, yüzdelik dilimler ve sıralamalar kendi YÖKSİS listesinden hesaplanır.
Atıf yapan yayınlar Crossref DOI’li 50 makaleye atıf yapan 1.327 yayın · 42 Türkiye adresli
- 2018 7
- 2019 238
- 2020 340
- 2021 469
- 2022 133
- 2025 117
- 2026 23
- DOI 10.1016/j.jcv.2025.105901 2026 · bu akademisyenin 2 makalesine atıf
- DOI 10.1016/j.fsi.2025.111020 2026
- DOI 10.1016/j.chroma.2025.466552 2026
- DOI 10.1016/j.ibmb.2025.104447 2026
- DOI 10.1016/j.jprot.2025.105538 2026
- DOI 10.1182/blood.2025028481 2026
- DOI 10.1016/j.phymed.2025.157616 2026
- DOI 10.1016/j.csbj.2025.12.010 2026 · bu akademisyenin 3 makalesine atıf
- DOI 10.1016/j.jinorgbio.2025.113164 2026
- DOI 10.1039/d5nr03228h 2026
- DOI 10.1016/j.bbamcr.2025.120097 2026
- DOI 10.1016/j.jhazmat.2025.140736 2026
- DOI 10.1016/j.jmgm.2025.109258 2026 · bu akademisyenin 2 makalesine atıf
- DOI 10.1128/mbio.02119-25 2026
- DOI 10.1016/j.compbiolchem.2025.108788 2026
- DOI 10.1016/j.bbrc.2025.153059 2026
- DOI 10.1182/bloodadvances.2025018046 2026
- DOI 10.1128/iai.00361-25 2026
- DOI 10.1016/j.bcp.2025.117565 2026
- DOI 10.1016/j.mrfmmm.2025.111927 2026
- DOI 10.1016/j.vaccine.2025.128051 2026
- DOI 10.1039/d5cb00278h 2026
- DOI 10.1039/d5cp02358k 2026
- Comparative Structural Analysis of Escherichia Coli Cyay at Room and Cryogenic Temperatures Using Macromolecular and Serial Crystallography TR Alaleh Shafiei ve diğ. · ChemBioChem · 2025 · bu akademisyenin 2 makalesine atıf
- Yippee-like protein Moh1 links gene expression to metabolism and selective stress resistance in Saccharomyces cerevisiae TR Çağla Ece Olgun ve diğ. · 2025
- Functional evaluation of NAA10 variants in patients with Ogden syndrome TR Aydeniz Aydin Gumus ve diğ. · Psychiatric Genetics · 2025
- Crystal Structure of 3-Hydroxypropionyl-CoA Synthetase (ADP-forming) from Nitrosopumilus maritimus TR Hasan Demirci ve diğ. · 2025
- Inhibition of FXa could be a novel therapeutic target associated with hypoxia-associated tumor behavior? TR Ozge Bayrak ve diğ. · Discover Oncology · 2025
- Investigation of Aquaporin-2 and its mutants with molecular dynamics simulations TR E. Deniz Tekin ve diğ. · Molecular Simulation · 2025
- A molecular docking and glycoinformatics approach reveals viral NS4A–human Sec61G interaction in Zika/Dengue infections TR Muhammet Uslupehlivan ve diğ. · Future Virology · 2025
En yeni 30 yayın gösteriliyor.
Bu liste nereden geliyor?
Crossref’in kamuya açık Mart 2026 veri dökümündeki referans listelerinden çıkarılmıştır; dökümün %20.3’i işlenmiştir, bu yüzden liste eksik olabilir. Crossref atıfları OpenAlex atıf sayılarıyla toplanmaz ve karşılaştırılmaz; iki kaynağın kapsamı farklıdır.
Alan sıralaması
YÖKSİS makale puanına göre ana dal, yan dal ve anahtar kelime kohortlarındaki yeri; her kart o sıralama sayfasına gider.
-
Ana dal Fen Bilimleri ve Matematik Temel AlanıPuan sırası #836/ 11.969 üst %7,0 Üniversitede #16/ 194Puan 53 dergi 47 · OA ek 6
- Makale sırası1.985/11.969
- Scopus sırası1.156/11.969
- WoS sırası1.087/11.969
- YÖKSİS50
- Scopus47
- WoS48
-
Yan dal Moleküler Biyoloji ve GenetikPuan sırası #24/ 765 üst %3,1 Üniversitede #1/ 20Puan 53 dergi 47 · OA ek 6
- Makale sırası63/765
- Scopus sırası34/765
- WoS sırası31/765
- YÖKSİS50
- Scopus47
- WoS48
Anahtar kelime sıralamaları 1
Çalışmalar 50
YÖKSİS ve OpenAlex kayıtları: dizin dağılımı, yayın yapılan dergiler, daraltılabilir makale listesi ve diğer çıktı türleri.
Dizinler ve atıf yüzdelikleri
?Diğer sayımlar
Scopus (SJR)
- YÖKSİS satırı 47
WoS (JCR)
- YÖKSİS satırı 48
Makaleler
YÖKSİS ve OpenAlex kaynak ayrımıyla makaleler; quartile ve TR Index ile daraltabilirsiniz.
Yayını olan dergiler
34 dergi
- Proteins: Structure, Function and Genetics 12
- ISSN 2636-8277 2
- Frontiers in Molecular Biosciences 2
- Journal of Molecular Biology 2
- Nature Protocols 2
- Turkish Journal of Biology 2
- ISSN 0907-4449 1
- ACS Omega 1
- Cancer Immunology, Immunotherapy 1
- Cell 1
- Cells 1
- ChemBioChem 1
- Communications Biology 1
- eLife 1
- European Journal of Medical Genetics 1
- Frontiers in Cell and Developmental Biology 1
- iScience 1
- Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 1
- Journal of Chemical Information and Modeling 1
- Journal of Human Genetics 1
- Methods 1
- Molecular and Cellular Proteomics 1
- Molecular Cell 1
- Molecules 1
- Nature Methods 1
- Nucleic Acids Research 1
- Oxidative Medicine and Cellular Longevity 1
- PLOS Computational Biology 1
- PLOS ONE 1
- Protein Science 1
- RNA Biology 1
- Scientific Reports 1
- Structure 1
- Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science 1
Daralt
Makale listesi
- 2025 Towards a Greener AlphaFold2 Protocol for Antibody–Antigen Modeling: Insights From CAPRI Round 55 YÖKSİS SJR Q2 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 90.1%
- 2025 So close yet so far apart: distinct flanking sequence recognition by DNMT3A and DNMT3B YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 55.5%
- 2025 An NADH-controlled gatekeeper of ATP synthase YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex üst %10 OpenAlex 91.9%
- 2025 E2-regulated transcriptome complexity revealed by long-read direct RNA sequencing: from isoform discovery to truncated proteins YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 74.9%
- 2024 Dynamic proximity interaction profiling suggests that YPEL2 is involved in cellular stress surveillance YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 74.0%
- 2024 The HADDOCK2.4 web server for integrative modeling of biomolecular complexes YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex üst %1 OpenAlex 100.0%
- 2023 Cryogenic X-ray crystallographic studies of biomacromolecules at Turkish Light Source Turkish Delight YÖKSİS TR Index SJR Q2 JCR Q3 OpenAlex 84.2%
- 2023 The impact of AI‐based modeling on the accuracy of protein assembly prediction: Insights from CASP15 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 96.1%
- 2023 Breaking the conformational ensemble barrier: Ensemble structure modeling challenges in CASP15 YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex üst %10 OpenAlex 93.9%
- 2023 Rapid and efficient ambient temperature X-ray crystal structure determination at Turkish Light Source YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1
- 2023 PROT-ON: A structure-based detection of designer PROTein interface MutatiONs YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 47.4%
- 2023 Benchmarking the accuracy of structure‐based binding affinity predictors on Spike–ACE2 deep mutational interaction set YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 58.6%
- 2023 An alternatively spliced PD-L1 isoform PD-L1∆3, and PD-L2 expression in breast cancers: implications for eligibility scoring and immunotherapy response YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 86.0%
- 2023 Differential Occupancy and Regulatory Interactions of KDM6A in Bladder Cell Lines YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 51.9%
- 2023 Molecular Mechanism of Nucleosome Recognition by the Pioneer Transcription Factor Sox YÖKSİS SJR Q1 JCR Q1 OpenAlex 73.0%
- 2022 Novel biallelic variants affecting the OTU domain of the gene OTUD6B associate with severe intellectual disability syndrome and molecular dynamics simulations YÖKSİS SJR Q2 JCR Q4 OpenAlex 64.9%
- 2022 Enzymatic Generation of Double‐Modified AdoMet Analogues and Their Application in Cascade Reactions with Different Methyltransferases YÖKSİS SJR Q1 JCR Q3 OpenAlex 74.1%
- 2022 VARS1 Mutations Associated with Neurodevelopmental Disorder Are Located on A Short Amino Acid Stretch of The Anticodon-Binding Domain YÖKSİS TR Index SJR Q2 JCR Q3 OpenAlex 54.7%
- 2022 Modeling the Dynamics of Protein–Protein Interfaces, How and Why? YÖKSİS SJR Q1 JCR Q2 OpenAlex 77.8%
- 2022 Genetic complementation screening and molecular docking give new insight on phosphorylation-dependent Mastl kinase activation YÖKSİS SJR Q2 JCR Q1 OpenAlex 53.6%
Projeler 1
-
2021 Tropic: İlaç ile Hedeflenebilir İnsan-Parazit Etkileşimlerini Tanımlamayı Amaçlayan Bütüncül Bir Yaklaşım
Kitaplar 5
-
2025 HADDOCK
-
2021 PROTEİN: Yapısı, mühendisliği, etkileşimleri, dinamiği ve ilaç tasarımındaki yeri
-
2018 Therapeutic Proteins and Peptides (Advances in protein chemistry and structural biology, Volume 112)
-
2015 Molecular Modeling of Proteins
-
2012 NMR of Biomolecules: Towards Mechanistic Systems Biology
Bildiriler 1
-
— AI revolution in the structure prediction of biomolecular complexes
İşbirliği ağı
YÖKSİS eser kayıtlarındaki yazar listelerinden. Aynı eserin mükerrer kayıtları bir kez sayılır; kurumlar ortak yazarların YÖKSİS’teki güncel kurumudur.
- Ortak yazar
- 293
- akaturk profili olan
- 28
- Ulusal kurum
- 13
- Ortak yazarlı eser
- %98
Ortak çalıştığı akademisyenler 28
- AYŞE ELİF ERSON BENSAN Profesör · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 3
- AYŞE SEMRA HIZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 3
- GÖKHAN KARAKÜLAH Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 3
- TÜRKAN HALİLOĞLU Profesör · Boğaziçi Üniversitesi 3
- AHMET KATI Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 2
- BURAK VELİ KABASAKAL Doktor Öğretim Üyesi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 2
- BURCU KAPLAN TÜRKÖZ Doçent · Ege Üniversitesi 2
- HASAN DEMİRCİ Doçent · Koç Üniversitesi 2
- MUHAMMED KASIM DİRİL Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 2
- SERDAR DURDAĞI Profesör · Bahçeşehir Üniversitesi 2
Tümünü göster (28)
- SEVDE ALTUNTAŞ Doçent · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 2
- ULUÇ YİŞ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 2
- İBRAHİM ÖZGÜL Araştırma Görevlisi · Orta Doğu Teknik Üniversitesi 2
- ŞABAN TEKİN Profesör · Sağlık Bilimleri Üniversitesi 2
- AHMET SÜREYYA RİFAİOĞLU Doktor Öğretim Üyesi · Hacettepe Üniversitesi 1
- ATHANASIA PAVLOPOULOU Doktor Öğretim Üyesi · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
- BİLGE ÖZGÖR Doçent · İnönü Üniversitesi 1
- ERHAN BAYRAM Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 1
- GİZEM DİNLER DOĞANAY Profesör · İstanbul Teknik Üniversitesi 1
- HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN Profesör · İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1
- MEHMET ÖZTÜRK Profesör · İzmir Tınaztepe Üniversitesi 1
- SERAP ERKEK ÖZHAN Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
- SEYİT KALE Doktor Öğretim Üyesi · İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1
- SULTAN CİNGÖZ Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
- TÜLAY ÖNCÜ ÖNER Doktor Öğretim Üyesi · Manisa Celâl Bayar Üniversitesi 1
- YAVUZ OKTAY Doçent · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
- ŞERİF ŞENTÜRK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
- ŞERİFE ESRA ERDAL BAĞRIYANIK Profesör · Dokuz Eylül Üniversitesi aynı üniversite 1
Ulusal işbirliği 13 kurum
Kurum içi8 ortak eser · Dokuz Eylül Üniversitesi
- Orta Doğu Teknik Üniversitesi 5 eser · 3 akademisyen
- Boğaziçi Üniversitesi 3 eser · 1 akademisyen
- Bahçeşehir Üniversitesi 2 eser · 1 akademisyen
- Ege Üniversitesi 2 eser · 1 akademisyen
- Koç Üniversitesi 2 eser · 1 akademisyen
- Sağlık Bilimleri Üniversitesi 2 eser · 3 akademisyen
- İzmir Tınaztepe Üniversitesi 2 eser · 2 akademisyen
- Hacettepe Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
- Manisa Celâl Bayar Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
- İnönü Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
Tümünü göster (13)
- İstanbul Teknik Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
- İzmir Katip Çelebi Üniversitesi 1 eser · 1 akademisyen
- İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü 1 eser · 1 akademisyen
Diğer ortak yazarlar (yabancı yazarlar dahil) 265
Alexandre MJJ Bonvin 15Panagiotis Kastritis 9Adrien S Melquiond 8Joao PGLM Rodrigues 8Burcu Özden 6Büşra Savaş 6Marc van Dijk 5Christophe Schmitz 4Mehmet Ergüven 4Mikaël Trellet 4Sjoerd de Vries 4TÜLAY KARAKULAK 4Zundert Gydo van 4İREM YILMAZBİLEK 4Andriy Kryshtafovych 3Didem Naz Dioken 3Mehdi Koşaca 3Melda Tozluoğlu 3Ruth Nussinov 3Abdullah Kepceoğlu 2Alaleh Shafiei 2Aleksandra Bebel 2Andrea Graziadei 2Annalisa Bordogna 2Atakan Özsan 2Ayşe Berçin Barlas 2Ayşe Berçin Barlas Yılmaz 2Bengisu Aşci 2Bilge Tosun 2Brian Jiménez-García 2Cahine Kulakman 2Ebru Destan 2Eda Şamiloğlu 2Enver Kamil Akcan 2Esra Ayan 2Halilibrahim Çiftçi 2J. Austin Johnson 2Kardelen Şabanoğlu 2Masami Otsuka 2Mehmet Gül 2
Tümünü göster (265)
Mikako Fujita 2Nazlı Eylül Arslan 2Necati Atalay 2Nilüfer Baldır 2Nurettin Tokay 2Orsolya Barabas 2SEVAL KILIÇ 2Serra Tavlı 2Seyide Seda Paydos 2TOLGA CAN 2Zeliş Nergiz 2Ömür Güven 2AHMET YARAMIŞAYÇA ÇIRÇIRAdriana ContrerasAdrien S. J. MelquiondAhmet BursalıAileen PetersAlbert SolernouAlexandros G. GeorgakilasAleyna ErayAli HamicheAlirıza ArıbaşAlma BalestrazziAmande PaulsAna TöpfAndrea RentmeisterAndreas RoosAnna L DuncanAnna Rubio-CosialsAnna VangoneAnnageldi AshyralyyevAnnalisa PastoreAnne KoyAnnette HornArif MermerAybike ErdoğanAyşegül PazarçevirenAyşenur YılmazBanushree KumarBarış ÇakılkayaBaşak CanbayBirgit AssmannBradley P. CoeBrian G. PierceBurcu EkinciCan YükrükCarlo PetosaCarlos Rojas-CordovaCengiz Kaan FerahChantal PrevostChaok SeokCharlotte W. van NoortChiara PallaraChristian EggelingChristian MT SpahnColin KleanthousCunlian CengDaniel G. MacArthurDaniel J. RigdenDaniel-Cosmin MarcuDaron M. StandleyDavid SchwefelDavid W. RitchieDeborah A. NickersonDenisa HathaziDeniz KaragözoğluDhanya CheerambathurDima KozakovDimitar AngelovECE SÖNMEZLER ADALIERDİNÇ SEZGİNESRA ÇİÇEKEfrat FarkashEiji KanamoriEike C SchulzElanur AlmericElmasnur YilmazEsra KartalEvan E. EichlerFabian SchildhauerFatma Betül ErtemFatma Betül Ertem KuzucuFrancis J O’ReillyGaetano T. MontelioneGamze YeşilayGeorgy DerevyankoGeorgy SmyshlyaevGilbert WunderlichGiuseppe NicastroGizem TuranGÖZDE KÖKSAL BIÇAKCIGÜNEY BADEMCİGözde KarakadioğluGözde Karakadıoğlu UstaGülden Özden YılmazGünce GöçGünseli YıldırımHIROSHI TATEISHIHahnbeom ParkHaim J. WolfsonHaluk CetinokHanns LochmullerHaruki NakamuraHasup LeeHazal AytenHelge EwersHelin GümüsboğaHenry L. PaulsonHolger ThieleHormos Salimi DafsariHowook HwangHuan-Xiang ZhouHülya-Sevcan DaimagülerIain H. MoalIdit BuchIlya A. VakserImtiaz N. LoneIpek KalafatcilarIrem Cemile ErogluIsabelle VernosJan BednarJanine AltmüllerJeffrey J. GrayJianqing XuJohn MoultJohn WietingJorge Roel-TourisJoy SarmientoJoão P RodriguesJuan Fernández-RecioJulie C. MitchellJunsu KoJuri RappsilberJustyna A. WojdylaJörg J. SchaarschmidtKarl Emanuel BuschKarl KieningKate JeffreyKengo KinoshitaKerstin BeckerKita SchmidtKoen M VisscherKrishna Praneeth KilambiKristoffer ForslundLaura Pérez-CanoLensink Marc FLi C XuwLotte LambertsenMESUT MUYANMUSTAFA CENGİZ YAKICIERMUSTAFA TEKİNALP GELENMahmut AslanManja KlossMarchel StuiverMarco GiuliniMark S. P. SansomMartin ZachariasMatsuyuki ShirotaMatthieu ChaventMehdi NellenMehmet ÇalısekiMelis OktayoğluMerv YılmazMerve YılmazMira Schulze-RhonhofMiriam EisensteinMuratcan MenteşMustafa ÇicelNazmiye ArslanNora SzaboOzgun OzalpPanagiotis I. KoukosPaul A. BatesPeer BorkPelin TokerPeter NürnbergPetra SJ RylPetras J. KundrotasPravin MuthuRamachandran BoopathiRita HorvathRodrigo V. HonoratoRosanne SpruteSERDAL GÜNGÖRSanbo QinSandor VajdaSapthaswaran VeerapathiranSebahattin CirakSergei GrudininSergi BeltranSeynep Sena ÇınalShahram MesdaghiShen-You HuangShoshana J. WodakSiddarth NarasimhanSimon M LauerSokol TodiSolène GrosdidierSophie Sacquin-MoraStefan DimitrovSteven LaurieSunitha BalarajuSwantje LenzTeresa CarlomagnoThom VrevenThorsten WohlandUniversity of Washington Center for Mendelian GenomicsUtku Cem YılmazVasileios R OuzounidisVictor ReysW Marshall StarkXiaoqin ZouYang ShenYağmur AzbazdarYoichi MurakamiYuko TsuchiyaZEYNEP KÜRKÇÜOĞLU SONERZhiping WengZuzana JandováÁlvaro Aranguren-IbáñezÇAĞLA ECE OLGUNÇİĞDEM ERESEN YAZICIOĞLUİlkin YapıcıŞevki Onur Henden
akaturk profili olmayan yazarlar (yabancı araştırmacılar, emekli/ayrılmış akademisyenler, öğrenciler, klinisyenler) isim yazımına göre birleştirilir; “Güllüce M.” gibi kısaltmalar tek bir tam adla eşleşiyorsa o kişiye eklenir.