Investigation of Antibiotic Resistance Genes and Class 1 Integron in MultiDrug Resistant P. aeruginosa and E. coli Strain

OpenAlex Türkçe

P. aeruginosa ve E.coli izolatlarının birçok antibiyotiğe direnç kazanması nedeniyle bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi zorlaşmıştır. Bundan dolayı klinik izolatlarda antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı çoklu-ilaç dirençli P. aeruginosa ve E.coli klinik suşlarında beta laktamaz direnç genlerinin ve sınıf 1 integronlar gen kasetlerinin varlığının araştırılmasıdır. Gümüşhane Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan, idrar ve balgam örneklerinden izole edilen 2 P. aeruginosa ve 2 E.coli izolatlarının tanımlaması ve antibiyogramı Vitek 2 Compact otomatize sistemi ile çalışılmıştır. Total DNA izolasyonu kaynatma DNA metoduyla yapılmıştır. blaVIM, blaNDM, blaIMP, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-40, blaKPC ve sınıf 1 integron gen kasetlerine ait primerler kullanılarak PZR’ler gerçekleştirilmiştir. Amplikasyonun gerçekleştiği tüm örnekler %1’lik agaroz jelde yürütülmüştür ve daha sonra UV ışığında görünür hale getirilmiştir. Antibiyogram sonucuna göre P. aeruginosa izolatları gentamisin hariç kullanılan tüm antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. E.coli izolatlarının ise karbapenemlere karşı duyarlı sefalosporin grubu antibiyotiklere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Sınıf A beta laktamaz genlerinden blaCTXM-1 4 suşun 3’ünde bulunurken, hiçbir suşta blaCTXM-2, blaKPC ve blaGES genleri tespit edilmemiştir. Araştırılan sınıf B ve sınıf D beta laktamaz genlerinin varlığı hiçbir örnekte görülmemiştir. 3 suşta sınıf 1 integronun varlığı tespit edilmiştir. DNA dizi analiz sonucuna göre üç integron pozitif örneğin dfrA17/AadA5 gen kasetine sahip olduğu belirlenmiştir.